Wyższa uczelnia katolicka w Gorzowie istniała od 1988 r., kiedy to została powołana przez ówczesnego biskupa diecezjalnego Józefa Michalika jako Instytut Formacji Katolickiej. Od początku Instytut był filią wrocławskiego Papieskiego Wydziału Teologicznego. Wielki wkład w jego powstanie i rozwój miał ks. prof. dr hab. Roman Harmaciński.
Mimo iż uczelnia od początku swego istnienia kładła nacisk przede wszystkim na dyscypliny teologiczne, a więc Pismo Święte, teologię moralną, prawo kanoniczne, dogmatykę, studiujący mieli też możliwość zgłębiania np. filozofii, pedagogiki i psychologii, historii, etyki czy antropologii filozoficznej. Uczelnia od początku otwarta była na ludzi poszukujących prawdy. Warto dodać, że dla wielu osób studia w tym miejscu nie były spowodowane wyłącznie chęcią zdobycia stopnia naukowego - liczni studenci mieli już skończone inne kierunki i przychodzili tutaj z pragnieniem pogłębienia wiedzy i dalszego rozwoju.
Początkowo siedzibą gorzowskiej uczelni były pomieszczenia należące do parafii katedralnej. Studentom swoją bibliotekę udostępnił Klub Inteligencji Katolickiej oraz Wyższe Seminarium Duchowne w Paradyżu. Od razu też przystąpiono do adaptacji na potrzeby nowej uczelni domu parafialnego budowanego przy ul. Żeromskiego. Uroczyste otwarcie miało miejsce w roku akademickim 1990/91. Kolejne prace pozwoliły uzyskać uczelni 52 pomieszczenia, wśród których wymienić można bibliotekę, archiwum, kaplicę, mieszkania profesorów itp.
W czerwcu 1998 r. uczelnia przekształciła się w sekcję Wydziału Teologicznego Uniwersytetu Adama Mickiewicza w Poznaniu i stała się ósmą sekcją tego wydziału (obok sekcji funkcjonujących w Paradyżu, Koszalinie, Obrze, Gnieźnie, Kaliszu, Bydgoszczy i Szczecinie).
W 2002 r. podjęto decyzję o założeniu w Zielonej Górze Instytutu Filozoficzno-Teologicznego im. Edyty Stein i utworzeniu na jego bazie sekcji Wydziału Teologicznego UAM w Poznaniu. Bp Adam Dyczkowski - któremu zależało na tym, aby teologia była w mieście, gdzie ma swoją stolicę diecezja zielonogórsko-gorzowska - zadecydował, że nowa uczelnia w ciągu kilku lat całkowicie zastąpi Instytut w Gorzowie.
W 2004 r. na Uniwersytecie Szczecińskim powstał Wydział Teologiczny. W związku z tym w ramach metropolii szczecińskiej, do której należy nasza diecezja, oba Instytuty - gorzowski i zielonogórski - stały się sekcją Wydziału Teologicznego Uniwersytetu Szczecińskiego.
Obecny rok akademicki ostatecznie zakończył działalność gorzowskiej uczelni. Tęsknić za nią będzie wielu mieszkańców Gorzowa, którzy obawiają się, że na zmianie ucierpi życie kulturalne miasta. Poza tym zżyli się z myślą, że w Gorzowie jest uczelnia i teraz trudno im się z nią rozstać. O Instytucie ciepło wyrażają się też sami studenci: - Bardzo miło będę wspominał lata studiów. Ten czas to nie tylko nauka, ale również atmosfera tego miejsca, wspólne imprezy, wyjazdy. Świetne spotkania w gronie kolegów i przesympatycznych koleżanek - mówi Damian Pijarski.
Ostatni rok bronił swoje prace magisterskie 22 czerwca. - Do obrony przystąpiło 15 osób. Wszystkie oczywiście odniosły sukces. Rok akademicki zakończyliśmy uroczystą Mszą św. dziękczynną za 5 lat studiów i wielką pożegnalną imprezą - opowiada Anna Kielar.